主角百夜白，出生在一个魔法与科技共和的世界。这个世界，所有人都有“魔力”，几乎所有科技都需要“魔力”才能使用。而百夜白是个没有魔力的人，因此被判为“残疾人”。同时，这个世界有“魔物”。由于千年前，有因为魔法而发生的大屠杀。因此大众被禁止使用魔法。而不能使用魔法，怎么对付魔物？一个组织由此诞生；它是高危职业，同时也是高薪的；它是只有万中无一的天才才能加入的；它是唯数不多被允许使用魔法的职业；它便是—斩魔人。

而成为斩魔人，需要先接受“斩魔人学院”的教育，才能成为斩魔人。

其存在的意义，便是教导学生魔法，魔物，等知识。

而男主百夜白，在许多机缘巧合下，被斩魔人学院校长邀请加入斩魔人学院。

从此展开了一连串的故事。