高中生侦探工藤新一，人称“平成年代的福尔摩斯”“日本警察的救世主”。因试图跟踪黑衣组织成员被偷袭，并被灌下代号“APTX4869”的毒药，虽然幸免于死，但身体缩小成一年级小学生的模样。之后寻求阿笠博士的帮助，在被青梅竹马毛利兰询问自己名字时，化名为江户川柯南。在阿笠博士的提议下，寄住于小兰的父亲毛利小五郎家中，解决各种案件的同时秘密调查黑衣组织。

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